Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms