Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Polr1aO35134 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Polr1aO35134 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Polr1aO35134 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms