Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim22J3QP37 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms