Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21976J3QNN2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21976J3QNN2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms