Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccdc180J3QNE4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ccdc180J3QNE4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms