Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3336J3QMQ6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms