Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c3J3QJW5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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