Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Taf4bG5E8Z2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Taf4bG5E8Z2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms