Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcf11G3X9Z4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcf11G3X9Z4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms