Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms