Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Srp72F8VQC1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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