Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc6F8VPZ5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ercc6F8VPZ5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms