Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Colca2F8VPY8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms