Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Farp1F8VPU2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms