Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.31■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.29■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
D430041D05RikF6ZGR6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms