Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Gm8005F6YKY3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Gm8005F6YKY3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms