Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Crocc2F6XLV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Crocc2F6XLV1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms