Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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