Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8N6

Aknad1, AKNA domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aknad1E9Q8N6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Aknad1E9Q8N6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Aknad1E9Q8N6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms