Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Urb2E9Q7L1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms