Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp31E9Q6Y8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms