Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga10E9Q6R1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms