Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FancfE9Q5Z5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms