Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pde8bE9Q4S1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pde8bE9Q4S1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms