Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp1E9Q368 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms