Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430401F13RikE9Q328 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms