Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Zfp558E9Q1J0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zfp558E9Q1J0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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