Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0M3

Gm9268, Predicted gene 9268, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9268E9Q0M3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm9268E9Q0M3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm9268E9Q0M3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms