Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ryr1E9PZQ0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ryr1E9PZQ0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms