Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc8E9PWG2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms