Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc144bE9PVZ3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms