Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ttc17E9PVB5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms