Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc175E9PVB3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc175E9PVB3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms