Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifit3bE9PV48 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifit3bE9PV48 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms