Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm3252E9PUT9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms