Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clca3bE9PUL3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms