Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Samd1D3YXK1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms