Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Loxhd1C8YR32 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Loxhd1C8YR32 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms