Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Gm17333C6EQI3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Gm17333C6EQI3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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