Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmf1B9EKI3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmf1B9EKI3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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