Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cttnbp2B9EJA2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cttnbp2B9EJA2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms