Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pdzd8B9EJ80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdzd8B9EJ80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms