Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr3aB2RXC6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr3aB2RXC6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms