Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cped1B2RX70 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cped1B2RX70 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms