Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clrn2B2RVW2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms