Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Apol7aB2RT54 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Apol7aB2RT54 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms