Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Otud4B2RRE7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms