Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ythdc2B2RR83 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ythdc2B2RR83 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms