Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox1B1APN4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms