Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttll11A4Q9F4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ttll11A4Q9F4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms